Lee Ann Galindo, une de nos malacoexploratrices a soutenu sa thèse hier.
Beaucoup de ses spécimens d'étude proviennent des expéditions de "La Planète Revisitée". Je me souviens de ma rencontre avec Lee Ann en Papouasie à Madang. C'est elle qui m'avait expliqué la technique du micro-onde.
Des jours à faire des prélèvements de tissus sur des Mollusques Gastéropodes, des marées de nuit sur l'estran de petites îles du lagon, des immersions en eaux troubles dans les estuaires et les mangroves... après les collectes, tout ce travail de recherche pour soutenir ce 15 septembre 2014.
Thèse qu'elle a obtenue avec les félicitations du jury !

Sujet : "Phylogénie, espèces cryptiques et endémisme chez les Nassariidae : approche intégrative".

La thèse a été soutenue publiquement devant le jury composé de :
- Yuri Kantor, Professeur, Russian Academy of Sciences (rapporteur)
- Rafael Zardoya, Professeur, Museo Nacional de Ciencias Naturales Madrid (rapporteur)
- Serge Gofas, Professeur, Universidad de Malaga (examinateur)
- Thierry Backeljau, Professeur, Royal Belgian Institute of Natural Sciences (examinateur)
- Stéphane Hourdez, CR1 CNRS-UPMC, Station Biologique de Roscoff (examinateur)
- Pierre Lozouet, Ingénieur de Recherche, Muséum national d’Histoire naturelle, Paris (examinateur)
- Philippe Bouchet, Professeur, Muséum national d’Histoire naturelle, Paris, (directeur de thèse)
- Nicolas Puillandre, Maitre de Conférences, Muséum national d’Histoire naturelle, Paris (encadrant)

Lee Ann Galindo dans le laboratoire de terrain © Thierry Magniez-MNHN-PNI / expédition Madang

Résumé par Lee Ann :
Les Nassariidae appartiennent à un groupe de mollusques charognards qui se sont diversifiés sur les fonds meubles et les rivages rocheux, et font l'objet de nombreuses recherches en écologie, écotoxicologie et paléontologie. Une faible et/ou apparente variation continue des caractères de la coquille a donné lieu à une systématique confuse, ce qui a faussé les études écologiques et évolutives. Plus de 1330 espèces nominales ont été établies pour les espèces récentes dont 448 sont actuellement considérées comme valides, autrefois réparties en quatre sous-familles et neuf genres. Une analyse moléculaire basée sur trois gènes mitochondriaux (COI, 16S, 12S) et deux gènes nucléaires (28S, H3) a été réalisée en utilisant un ensemble de données qui comprend 50% de la diversité connue de la famille. Selon les interprétations classiques, la monophylie des Nassariidae n’est ici pas confirmée, à moins d’y inclure plusieurs genres de Buccinidae dans la famille. Ces résultats ont un impact profond sur la taxonomie des nasses, en particulier en ce qui concerne la validité des noms au niveau du genre. La validité de six sous-familles et seize genres est discutée. Une reconstruction des caractères ancestraux et l'estimation des temps de divergence ont permis d'inférer l'histoire évolutive du clade afin d’expliquer la répartition géographique et d'identifier les caractères informatifs qui pourraient être utilisés pour la taxonomie opérationnelle à différents niveaux. Les caractères de la coquille restent utiles pour reconnaître les espèces de Nassariidae mais insuffisants pour définir des relations phylogénétiques. Les étalonnages fossiles indiquent une origine crétacée des nasses. Une approche intégrative de la taxonomie a également été appliquée pour discuter la délimitation d’espèces fondée sur les caractères de la coquille uniquement. Plusieurs cas de complexes d'espèces, y compris d’espèces cryptiques ont été détectés, permettant de constater que de nombreuses espèces attendent toujours d'être décrites dans la famille des Nassariidae.  

Faisons connaissance avec mes compagnons de voyage. Cyndie, cette jeune femme souriante de 27 ans est gestionnaire de collection (invertébrés marins) au MNHN mais aussi une technicienne confirmée, capable d’effectuer avec rigueur, en conditions de terrain, souvent difficiles les gestes indispensables à la conservation et l’enrichissement des collectes, futurs apports aux collections. Elle a ces derniers temps effectué de nombreuses missions dans le cadre de la planète revisitée en particulier à Madang puis Kavieng, en Papouasie Nouvelle Guinée et y a effectué des tâches de préparation et de conditionnement des échantillons.

Cyndie dupoux au premier soir © Cyndie Dupoux-MNHN-PNI / expédition Guyane

Durant cette mission, outre le travail obligatoire de tri des échantillons auquel elle participe comme nous tous, elle prépare dans le laboratoire humide du Hermano Gines, notre chalutier, les spécimens prélevés pour rendre le barcoding possible, en rentrant au Muséum, à Paris.

Laboratoire humide du navire © JC Vasseur-MNHN-PNI / expédition Guyane

Tout comme Lee-Ann Galindo l'a fait pour le Leg 1, elles sont toutes les deux grandes utilisatrices du four à micro-ondes !

LE four à micro ondes dans le laboratoire humide © JC Vasseur-MNHN-PNI / expédition Guyane

En effet, comme me l'a expliqué Lee Ann, qui a rédigé un article scientifique à ce sujet, en particulier pour les mollusques gastéropodes pour sortir les animaux de leur coquille le plus facilement sans les endommager, un petit passage au feu des ondes est nécessaire! De plus, il semble que ce procédé stabilise les individus en ce qui concerne la conservation de l'ADN avant leur mise en alcool. Pourquoi et comment? Le mystère reste entier, en effet l’article co-signé par Lee Ann et Philippe Bouchet ne se prononce pas sur le sujet. Un sujet de recherche à venir, peut être….

Cyndie va aussi prélever des tissus des spécimens qu’elle va mettre dans des micro tubes, dans de l’alcool, pour le barcode, toujours.

Un vrac de mollusque (cône et bivalves) prêt à être traité pour entrer dans les collections © JC Vasseur-MNHN-PNI / expédition Guyane

Cette façon de procéder échantillonnage des spécimens récoltés, puis prélèvement de tissus ou mise en alcool de l’animal complet, semble aujourd’hui nécessaire, pour le groupe des mollusques car il faut bien lever les doutes pour la détermination des espèces ! Deux individus morphologiquement identiques peuvent néanmoins appartenir à deux espèces différentes et d’autres, très différents morphologiquement peuvent appartenir au même taxon. Compte-tenu de l’énorme diversité taxonomique du groupe des mollusques cette pratique est indispensable !

Envoyé par Laure Corbari

Dans Asterix, tous les épisodes se terminent par un banquet sous la voute étoilée. Ici, à Kavieng, c'est le deuxième leg de la campagne KAVIENG qui commence par un banquet. Bon, enfin pas tout à fait un banquet (et il n'y a pas de sanglier ☺), mais le changement d'équipe à bord de l'Alis (navire de l’IRD, utilisé pour les legs) a été l'occasion de se retrouver pour un moment de détente convivial.

Arrivée sur l'île de Nusa en Banana Boat © J. Abdelkrim-MNHN-PNI-IRD/expédition Kavieng

Retour sur les épisodes précédents :

30 juin 2014 : Les 35 participants à l'atelier du "Kavieng Lagoon Marine Biodiversity Survey" quittent Nago Island, d'où ils ont exploré la faune et la flore marine de ce lagon de 30.000 hectares s'étendant entre le bout de la Nouvelle-Irlande et l'ile du Nouveau-Hanovre.

Vue aérienne de la baie de Balgai © Thierry Magniez-MNHN-PNI-IRD/expédition Kavieng

8 août : L'Alis arrive à Kavieng, la capitale de la province de Nouvelle-Irlande, après un périple extraordinaire qui, depuis la Nouvelle-Calédonie, le 25 mars, l'a emmené en Papouasie Nouvelle-Guinée puis jusqu'au Vietnam, puis ramené en Papouasie Nouvelle-Guinée pour charger à Madang les équipements et le matériel de pêche laissés par la campagne MADEEP.

11 - 25 août : L'équipe de Claude Payri conduit à bord de l'Alis, le premier leg de la campagne KAVIENG qui cible les algues, les coraux et la typologie des habitats, et complète ainsi les travaux effectués en juin dans le cadre du "Kavieng Lagoon Marine Biodiversity Survey".

26 août : L'équipe descendante (Claude Payri) et l'équipe montante (la notre) se croisent. C'est l'occasion de débriefer. C'est aussi l'occasion de marquer le coup vis à vis de tous ceux qui, à Kavieng, ont rendu possible ce programme d'expédition et facilité la logistique - scientifique, domestique et administrative -.

Soirée sur Nuas island © J. Abdelkrim-MNHN-PNI-IRD/expédition Kavieng

D'où cette soirée du 26 qui réunit l'équipage de l'Alis, les équipes scientifiques des deux legs, le personnel de Nago Island Mariculture and Research Facility, les opérateurs locaux de plongée, le représentant de la National Fisheries Authority, le personnel de Nusa Island Retreat qui, en juin, a assuré notre bien-être domestique, et d'autres encore. Le "Kavieng Lagoon Marine Biodiversity Survey" est davantage qu'un simple projet de recherche. Par sa dimension (plus de 40 participants de 12 pays) et sa durée (de juin à septembre), le projet est aussi un véhicule de culture scientifique et technique. Lors de l'atelier à terre à Nago, en juin, nous avons organisé des journées "portes ouvertes" et fait visiter le laboratoire aux villageois de notre zone d'étude, qui - dans un mélange de curiosité et de défiance - se demandaient ce que nous faisions chez eux.

Habitants de Tome visitant le laboratoire © Thierry Magniez-MNHN-PNI-IRD/expédition Kavieng

Nous avions également organisé des journées pédagogiques avec les lycéens des première et terminale scientifiques de la Our Lady of the Sacred Heart international school de Kavieng, et deux de ces lycéens ont fait avec nous un stage de 10 jours pendant lequel ils ont participé au travail de terrain, au travail de laboratoire, et partagé la vie de l'équipe.

Laure Corbarie et les élèves pour une journée au laboratoire © Thierry Magniez-MNHN-PNI-IRD/expédition Kavieng

Ces deux chanceux - Jedidiah et Zony - étaient bien sûr de la partie ce 26 août, avec leur professeure de sciences, Rachael, et le "Principal" du lycée et son adjointe. Cette soirée était en quelque sorte un avant-goût de leur rencontre avec la Nouvelle-Calédonie, puisque Jedidiah, Zony et Rachael doivent s'envoler le 15 septembre pour Nouméa, pour participer à l'édition 2014 de la Fête de la Science, où ils seront à l'honneur dans les trois villages de la Fête, à l'invitation de l'infatigable Jacqueline Sirieix et son association Symbiose. Ce 26 août, la présence de l'Alis est déjà l'occasion de faire connaitre cette Nouvelle-Calédonie à la fois si proche et si lointaine, et la composition multi-ethnique de l'équipage - composé de "métros", de kanaks, de ni-vans, de wallisiens - fait d'ailleurs forte impression sur nos hôtes.

Ile de Nago © J. Abdelkrim-MNHN-PNI-IRD/expédition Kavieng 

Ce 26 août, nous retrouvons donc notre cher vieux bateau, chargé jusqu'à la gueule. Le pont est en effet encombré du treuil hydrologique embarqué pour le Vietnam, et qui aurait dû être déchargé à Kavieng le temps de la mission. Seulement voilà, l'unique grue du port est en panne, et les quelques grues mobiles de travaux publics n'ont pas la capacité de décharger cet équipement de 5 tonnes. Il faudra donc organiser notre espace de travail auteur de cet encombrant treuil ; pas bien grave ! Ce 26 août, nous embarquons l'éthanol (pour les échantillons) - commandé à Singapour au mois de mars -, les perches (pour le chalut) - faites sur place à Kavieng -, et tout un assortiment de fûts, touques, et flaconnage, qui nous avions laissé à Nago Island depuis fin juin. Nous ressortons également des caisses, qui, en avril, avaient servi à la mission MADEEP, le petit matériel pour le tamisage, le tri et le laboratoire. Les pièces du puzzle sont assemblées, tout est prêt pour demain, notre premier jour de travail. Ce 26 août est notre première nuit à bord.